En el estado de Chiapas, durante la jornada electoral del 1 de junio, se reportó la no instalación de 12 casillas en municipios como Comitán, Bochil y San Cristóbal de Las Casas, debido a hechos como la detección de boletas previamente marcadas, alteración de documentación electoral y amenazas a funcionarios del INE. En algunos casos, sujetos desconocidos ingresaron a domicilios de presidentes de casilla para exigir los paquetes electorales, que fueron devueltos con boletas ya marcadas, lo que motivó la suspensión de la votación. El Instituto Nacional Electoral informó que ya se recaban evidencias para presentar las denuncias correspondientes ante la Fiscalía Especializada en Delitos Electorales.
